Projekti ambicioz/ Renditja e plotë e gjenomit të të gjitha specieve të gjalla në Tokë!

A ju kujtohet Projekti i Gjenomit Njerëzor, projekti ambicioz i nisur në vitin 1990 dhe i cili brenda 13 viteve ishte në gjendje të rendiste të gjithë gjenomin njerëzor? Që atëherë, teknikat e renditjes janë përmirësuar në mënyrë eksponenciale dhe ajo që dikur kërkonte vite mund të arrihet në shumë më pak kohë. Dhe nuk ka demonstrim më të mirë se Projekti Toka BioGenome, një projekt kaq ambicioz sa krijuesit e tij e kanë përcaktuar atë, në një speciale të publikuar në PNAS, “një goditje hëne”, të cilën mund ta përkthejmë si “një kimerë”. Qëllimi i saj? Për të renditur, brenda dhjetë viteve të ardhshme, gjenomin e plotë të të gjitha specieve të gjalla në Tokë.

Objektivi i vërtetë i projektit është të hartojë gjenomën e të gjitha specieve të njohura – një dokument i vitit 2011 vlerëson se ka rreth 8.7 milionë lloje në Tokë, por në fakt ne i kemi identifikuar dhe përshkruar ‘vetëm’ rreth 1.8 milionë. Pikërisht në to, për momentin, fokusohet Projekti Earth BioGenome, i cili përfshin 44 universitete dhe institute kërkimore të shpërndara në 22 vende të botës, si dhe pesëdhjetë projekte të tjera të lidhura që do të ndihmojnë në mbledhjen e të dhënave. Qëllimi i renditjes së gjenomit të gati dy milionë specieve të gjalla duket i paarritshëm, por siç shpjegon Jenny Graves, profesore e gjenetikës në Universitetin La Trobe dhe anëtare e EBP në The Conversation, është bërë i mundur nga përparimi i madh i bërë vitet e fundit nga teknikat e sekuencave. Graves shpjegon se ajo që dikur kërkonte vite, tani mund të arrihet në një kohë relativisht të shkurtër dhe mbi të gjitha me një çmim të ulët: disa mijëra dollarë për një gjenom të plotë, krahasuar me miliona disa vite më parë. Sipas Graves, kostoja totale e të gjithë EBP do të jetë më e vogël se shuma e shpenzuar për Projektin e Gjenomit Njerëzor, i cili u fokusua në një specie të vetme dhe jo gati dy milionë specie të ndryshme.

Afati kohor i Projektit të Tokës BioGenome përfshin tre faza. Në të parën do të sekuencohet gjenomi i rreth 9400 specieve të gjalla, secili përfaqësues i një familjeje të ndryshme taksonomike: kjo fazë duhet të përfundojë deri në vitin 2022. Më pas do të kalojmë në hapin tjetër: ka rreth 180.000 gjini të ndryshme në natyrë. dhe EBP do të renditë kështu gjenomin e 180,000 specieve model. Faza e tretë dhe e fundit do të shkojë në edhe më shumë detaje: është ajo në të cilën gjenomi i çdo specie të vetme të njohur do të renditet. Prandaj, brenda dhjetë viteve, EBP pret që të ketë në dispozicion gjenomet e plota të çdo kafshe, bime, kërpudhe dhe të gjithë eukariotëve të tjerë të njohur: një manual i vërtetë i historisë së jetës dhe evolucionit, i cili gjithashtu do të jetë i dobishëm për të kuptuar se si të mbrohen më së miri sekuenca. specie. FCS

Edel Strazimiri / SCAN

*Material i përgatitur nga portali SCAN. Ripublikimi mund të bëhet vetëm kundrejt citimit të autorësisë dhe burimit origjinal.